公車：

在臺南火車站前圓環之公車站搭乘市區公車14路(火車站→億載金城)，之後在健康二街站下車，於健康路三段右轉步行約2分鐘抵達本署。全程約50分鐘,公車票價全票18元。

火車：

乘坐至臺南火車站後，可選擇至本署方式:

1.搭乘公車：在臺南火車站前圓環之公車站搭乘市區公車14路(火車站→億載金城)，之後在健康二街站下車，於健康路三段右轉步行約2分鐘抵達本署。全程約50分鐘,公車票價全票18元。

2.搭乘計程車：出站往中山路直行，接中正路，左轉西門路，右轉健康路，至健康路三段與國平路口時，即抵達本署。全程約25分，約200元車資。

開車：

自國道一號中山高速公路(約330公里處)接86號快速道路，下永成路交流道，往市區接健康路左轉，至健康路三段與國平路口時，即抵達本署。

從永成路交流道至本署全程約25分。

高鐵：

乘坐至高鐵台南站後，可選擇至本署方式:

1.至2號出口處轉搭高鐵接駁車，至市政府站(全程約50分,目前免費)，再改乘計程車至本署(約10分及110元車資)。

2.出2樓驗票口後左轉搭乘台鐵區間車至火車站，全程約30分,全票25元，至台南火車站後，可參照公車及火車路線搭乘公車或計程車至本署。

航空：

出台南機場後，自大同路往市區方向直行，遇健康路左轉，至健康路三段與國平路口時，即抵達本署。

若搭乘計程車至本署，全程約20分，約250元車資。