臺南地方檢察署所轄地區包括了臺南市三十七個行政區域。總面積達到二千一百九十多平方公里，人口總數多達一百八十八萬多人。其中由於臺南市境內幅員遼闊，因此本署為加強便民措施，特別在增設新營區檢察官辦公室，受理新營、鹽水、柳營、白河、東山、後壁、學甲、將軍等九區的偵查案件。
